芹菜大斑型斑枯病由芹菜小壳针孢菌侵染所致，芹菜小斑型斑枯病由芹菜大壳针孢侵染所致，均属半知菌亚门壳针孢属真菌。大斑型斑枯病菌分生孢子器球形，直径为65～95微米；分生孢子无色透明，丝状，直或稍弯曲，具0～4个横隔膜（通常3个），大小为（13.4～34.2）微米×（1～2.5）微米。小斑型斑枯病菌分生孢子器球形、扁球形，直径为73～74微米；分生孢子无色透明，丝状，微弯曲，顶端较钝，具有0～7个横隔膜（大多数为3个），大小为（17～61）微米×（1.5～3.0）微米。孢子萌发时隔膜增多，并可断裂成若干段，每段均能产出芽管，孢子上又可生出孢子。
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